纳米防指纹油的防污本质上是在规定的有效期内提供一个没有污垢附着的涂层表面。可以采用不同的防污原理，但目前比较实用的是使用防指纹剂，有效控制表面附着力，抑制油污附着。这就要求纳米防指纹油能够满足防指纹剂的可控制要求，就具有一个稳定有效的防指纹和防手指渗出率。

纳米防指纹油的防污物理化

物理纳米防指纹油有两种：低表面能法和表面植绒法，低表面能法是研究较早且较有成效的方法，是利用硅、氟高聚合物表面能低，海洋生物难以附着的原理设计的。

表面植绒法是根据海洋生物容易附着在岩石和钢铁的表面，而不容易附着在柔软的海藻上的观察而设计的。将细涤纶长丝种植在布料上，附着在金属表面进行防污处理。实践对比证明其防污效果良好。

纳米防指纹油的防污电化

电化纳米防指纹油是日本较近提出的一种比较新颖的方法，这种方法是在金属表面涂上一层导电的防指纹油，通过微弱的电流，在涂层表面形成一层10μm厚的次氯酸离子层，可以防止油污、微生物等有防止附着的效果，对人体无害。

纳米防指纹油的防污生化

生化纳米防指纹油是基于活性蛋白酶能快速分解由蛋白质组成的海洋生物，避免其对船舶的污损的原理开发的，目前处于实验阶段。

纳米防指纹油的防污化学

化学纳米防指纹油是一种传统的防污方法，利用化学物质自清洁污垢，目前已经转向无毒环保防污。无毒环保防污已成为新型化学纳米防指纹油的主要防污方法。从化学分子结构的层面来看，生物体对物体表面的附着是通过某种化学键或极性力来完成的；

细菌在物体表面的附着是通过其负离子型聚合物之一作为黏合剂来实现的，如果在纳米防指纹油中加入特殊的化合物，切断其黏合作用的化学键，同时使用低表面能的纳米防指纹油，就可以达到防污的目的。